В соответствии с постановлением Государственного комитета обороны (ГОКО) от 08.10.1943 на серийных заводах были организованы отделы эксплуатации авиационной техники. В то же время приказом Народного комиссариата (Наркомата) авиационной промышленности СССР от 29.10.1943 № 532с в целях организации работ по повышению качества эксплуатируемой авиатехники, информирования руководства авиационной промышленности о состоянии эксплуатации для принятия соответствующих мер, организации восстановления неисправных самолетов и расследования летных происшествий был создан Отдел полевого ремонта самолетов. Затем приказом министра авиационной промышленности СССР от 18.05.1948 № 269 подразделение было преобразовано в Отдел эксплуатации материальной части.

В послевоенный период постановлением Центрального комитета КПСС и Совета министров СССР от 24.06.1964 Министерству авиационной промышленности (Минавиапрому, МАП) разрешалось использование в качестве своих уполномоченных специалистов опытно-конструкторских бюро (ОКБ) и опытных заводов с нахождением их в штатах своих предприятий. Функционирование института уполномоченных было важным направлением деятельности, нацеленным на повышение эффективности производства, выполнение программ развития военной и гражданской авиации, повышение надежности производимой промышленностью продукции.

В соответствии со структурой МАП, утвержденной постановлением ЦК КПСС и СМ СССР от 02.03.1965 (приказ МАП № 1 от 11.03.1965) организована Главная инспекция по качеству, а для оперативного решения вопросов, связанных с эксплуатацией выпущенных заводом изделий, на всех серийных заводах создается служба (отделы) эксплуатации, а на самолетостроительных и двигателестроительных заводах вводится должность заместителя главного инженера по эксплуатации. 10.07.1974 приказом МАП № 270 создано Главное управление гарантийного обслуживания и эксплуатации авиационной техники (11 ГУ).

В результате перестройки процессы экономических преобразований вызвали необходимость проведения реформ и в 11 ГУ Минавиапрома. Приказом министра авиационной промышленности от 28.02.1989 № 96 в штат 11 ГУ было переведено 110 уполномоченных МАП. Последующие экономические преобразования в стране обусловили необходимость создания на базе хозрасчетных подразделений 11 ГУ с сохранением задач и функций Государственного предприятия "Авиапромсервис" (ГП "Авиапромсервис") при Минавиапроме СССР (приказ МАП от 04.10.1991 № 844).

После проведения соответствующих регистрационных мероприятий, связанных с созданием нового предприятия, был издан приказ по Минавиапрому от 28.11.1991 № 941, в котором указано, что Государственное предприятие "Авиапромсервис" является правопреемником подразделений Главного управления гарантийного обслуживания и эксплуатации авиатехники.

День подписания приказа № 844, т.е. 4 октября 1991 года, считается днем рождения Федерального государственного унитарного предприятия "Авиапромсервис".

Все это время предприятие работало в интересах авиации Министерства обороны, Федеральной пограничной службы России, гражданской авиации, предприятий оборонных отраслей промышленности и решало задачи по сопровождению эксплуатации авиатехники, обеспечению ее исправности и готовности к применению, организации расследования авиационных происшествий и реализации мероприятий по обеспечению безопасности полетов.

В 90-х, когда приватизировались предприятия промышленности, в том числе и оборонного комплекса, постановлением Правительства РФ от 12.07.1996 № 802 ГП "Авиапромсервис" было включено в перечень предприятий и организаций, не подлежащих приватизации. В 2002 году распоряжением генерального директора Российского авиационно-космического агентства (Росавиакосмоса) от 19.03.2002 № 39 Государственное предприятие обрело статус Федерального государственного унитарного предприятия – ФГУП "Авиапромсервис", каковым остается и по сегодняшний день. 18.03.2008 статус предприятия был подтвержден Правительственной комиссией Российской Федерации.